Death City é o lar da famosa Death Weapon Meister Academy (Shibusen), uma academia técnica chefiada pelo Shinigami—o próprio Lord Death. Sua missão: criar Foices da Morte para o Shinigami empunhar contra os muitos males de seu mundo fantástico. Essas Foices da Morte, no entanto, não são feitas de armas físicas; em vez disso, elas nascem de híbridos humanos que têm a capacidade de transformar seus corpos em Armas Demoníacas, e somente depois de terem consumido as almas de 99 seres malignos e a alma de uma bruxa. Soul Eater Evans, uma Foice Demoníaca que parece se importar apenas com o que é "maneiro", almeja se tornar uma Foice da Morte com a ajuda de sua empunhadora, ou meister, Maka Albarn. A dupla contrastante trabalha e estuda ao lado do esquentado Black☆Star e sua atenciosa arma Tsubaki, assim como o próprio filho do Shinigami, Death the Kid, um empunhador duplo obsessivo-compulsivo das pistolas gêmeas Patty e Liz. Enquanto eles realizam missões para coletar almas e proteger a cidade das ameaças do mundo, os alunos da Shibusen trabalham juntos sob o sol zombeteiro para se tornarem mais sãos de mente, corpo e alma.