No alvorecer do século XXI, a magia, há muito considerada folclore e contos de fadas, tornou-se uma tecnologia sistematizada e é ensinada como uma habilidade técnica. Na Primeira Escola Secundária, a instituição para magos, os alunos são segregados em dois grupos com base em suas notas no exame de admissão: os "Flores", aqueles que recebem notas altas, são designados para o Primeiro Curso, enquanto os "Ervas" são alunos reservas designados para o Segundo Curso. Mahouka Koukou no Rettousei segue os irmãos Tatsuya e Miyuki Shiba, que estão matriculados na Primeira Escola Secundária. Ao fazer o exame, a prodigiosa Miyuki é colocada no Primeiro Curso, enquanto Tatsuya é rebaixado para o Segundo Curso. Embora suas notas nos testes práticos e seu status como "Erva" mostrem que ele é magicamente inepto, ele possui conhecimento técnico extraordinário, capacidades de combate físico e técnicas de magia únicas — fazendo de Tatsuya o irregular em uma escola secundária mágica.

Terceira temporada de Mahouka Koukou no Rettousei.

O jovem, porém temido, feiticeiro Zagan é um candidato a se tornar membro dos 13 Arquidemonios—um grupo dos feiticeiros mais poderosos do mundo—após a morte do membro mais antigo, Marchosias. Ao participar do leilão da propriedade do falecido Arquidemonio, Zagan encontra algo que não esperava: amor à primeira vista. O feiticeiro impulsivamente gasta todo o seu dinheiro para levar Nephelia, uma rara escrava élfica, de volta ao seu castelo. Dado o passado misterioso e perturbador da garota, há muito que Zagan precisa descobrir sobre sua nova companheira. No entanto, a falta de experiência de Zagan com o sentimento desconhecido do amor leva a muitos momentos embaraçosos entre ele e Nephelia, a quem ele chama carinhosamente de "Nephy". À medida que os dois se aproximam e ficam mais à vontade um com o outro, torna-se cada vez mais evidente que os sentimentos de Nephy podem não ser tão diferentes dos de Zagan.

Seguir os conselhos do deus sem rosto Hitogami parece ter sido uma maravilha para Rudeus Greyrat. Após se matricular na Universidade de Magia, como lhe foi recomendado, Rudeus reencontra sua amiga de infância Sylphiette, que se esforçou bravamente para curar sua condição. Os dois se aproximam cada vez mais e decidem organizar uma festa de casamento, convidando os amigos que fizeram ao longo dos anos para anunciar e formalizar seu relacionamento. No entanto, apesar de todas as bênçãos recentes, os problemas de Rudeus estão longe de terminar. A pesquisa que ele está ajudando Shizuka Nanahoshi a conduzir atinge um impasse, levando-a a um profundo desânimo, semelhante ao que ele experimentou em sua vida anterior. Além disso, uma carta de seu pai, Paul, traz complicações para os relacionamentos de Rudeus, e Sylphiette ainda sabe quase nada sobre seu verdadeiro passado. Diante desses problemas, Rudeus terá que aplicar as lições que aprendeu neste novo mundo para navegar pelos desafios que acompanham viver uma vida plenamente.

Em 1973, após a implacável Guerra Lunar de seis anos, a hostil espécie alienígena conhecida como BETA — Seres de Origem Extraterrestre que são Adversários da raça humana — invadiu a Terra, matando bilhões e devastando a Eurásia. Embora os BETA possam ser destruídos com armas convencionais, sua classe laser é capaz de eliminar frotas inteiras de aeronaves, forçando a humanidade a desenvolver trajes de combate gigantes chamados Combatentes Táticos de Superfície (TSF) para combatê-los. Quando os BETA alcançam o Japão em 1998, Yui Takamura, estudante de escola militar e piloto de TSF — ou eishi —, recebe a ordem de defender a última linha de defesa de Kyoto com seus colegas de classe. Ao custo de inúmeras vidas humanas e do sacrifício dos amigos de Yui, o Exército Imperial Japonês consegue repelir os invasores, deixando destruição em seu rastro. No entanto, esse encontro deixa Yui determinada a nunca mais permitir que algo assim aconteça. Três anos depois, agora uma tenente, Yui junta-se ao projeto XFJ, um programa de desenvolvimento de TSF com base no Alasca, Japão-Americano. Em uma equipe internacional composta pelo piloto de testes japonês-americano Yuuya Bridges e vários eishi de países perdidos para os BETA, a missão de Yui é ajudar a desenvolver o novo TSF japonês, o Shiranui. Em meio a tensões políticas herdadas da Guerra Fria, Muv-Luv Alternative: Total Eclipse acompanha a delicada missão de Yui e a jornada de Yuuya para superar os demônios do passado que ainda o assombram.