Enquanto a Quarta Guerra do Santo Graal continua sem um vencedor claro à vista, os servos restantes e seus Mestres são chamados pelo supervisor da Igreja Risei Kotomine, a fim de se unir e enfrentar uma ameaça iminente que poderia desfazer a Guerra do Graal e provocar o destruição da cidade de Fuyuki. A trégua desconfortável logo desmorona quando os Mestres demonstram que farão qualquer coisa em seu poder, não importa o quão desprezível, para vencer. As sementes da dúvida são semeadas entre Kiritsugu Emiya e Saber, seu Servo, à medida que suas ideologias conflitantes sobre heroísmo e cavalheirismo se chocam. Enquanto isso, um vínculo sinistro se forma entre Kirei Kotomine, que ainda busca encontrar seu propósito na vida, e um dos Servos restantes. Conforme a contagem regressiva para o fim da guerra chega a zero, o custo da vitória começa a confundir a linha entre a vitória e a derrota.