Já se passaram 10 anos desde que o Portão do Céu apareceu na América do Sul e o Portão do Inferno surgiu no Japão, velando o antes familiar céu noturno com uma paisagem opressiva. Com propósitos desconhecidos, esses Portões são espaços onde as próprias leis da física são ignoradas. Com o surgimento dos Portões, emergiram os Contratantes, que, em troca de sua humanidade, recebem habilidades sobrenaturais. Na cidade japonesa que cerca o Portão do Inferno, a Chefe da Seção 4, Misaki Kirihara, se encontra em desacordo com um infame Contratante codinome Hei. Chamado de "Ceifador Negro" no submundo, Hei, assim como seus associados, executa missões para o misterioso e implacável Sindicato, enquanto lentamente desvenda as camadas escuras que cobrem um plano nefasto que ameaça a própria existência dos Contratantes. Da mente de Tensai Okamura, surge um thriller de ficção científica que se apresenta como uma sutil exposição sobre uma guerra na qual posições políticas e justiça não têm influência — uma guerra travada exclusivamente nas sombras.