O Santo Império da Britannia é uma nação poderosa que usa sua força militar para expandir seu domínio, e a pequena nação insular do Japão é mais uma vítima. Durante um conflito mundial em 2010 conhecido como a Segunda Guerra do Pacífico, o país outrora orgulhoso foi reduzido a escombros e zombeteiramente renomeado para Área 11. No entanto, um estudante planeja libertar o Japão do controle da Britannia através de uma rebelião extraordinária. Seu nome é Lelouch Lamperouge, e ele é movido pelo ódio ao Império, planejando varrer seu nome maldito da face do planeta. Os planos maliciosos de Lelouch são inesperadamente acelerados ao encontrar a mulher misteriosa C.C., que lhe concede uma habilidade sobrenatural conhecida como Geass, que torna qualquer pessoa que Lelouch comanda incapaz de desafiar sua vontade. Agora armado com um poder devastador, Lelouch assume a persona de Zero, uma figura revolucionária que carrega as esperanças e os sonhos dos oprimidos ao redor do mundo. Ele jura restaurar a gloriosa nação do Japão e entregar retribuição divina à Britannia.