Yoichi Isagi estava a meros instantes de marcar um gol que levaria seu time de futebol do ensino médio aos nacionais, mas uma decisão de último segundo de passar a bola para seu companheiro de equipe custou-lhe essa realidade. Amargurado, confuso e desapontado, Isagi se pergunta se o resultado teria sido diferente se ele não tivesse feito o passe. Quando o jovem atacante retorna para casa, um convite da União Japonesa de Futebol o aguarda. Através de um processo de tomada de decisão arbitrário e tendencioso, Isagi é um dos trezentos atacantes Sub-18 selecionados para um projeto controverso chamado Blue Lock. O objetivo final do projeto é transformar um dos jogadores selecionados no atacante estrela da seleção japonesa. Para encontrar o melhor participante, cada "diamante bruto" deve competir contra outros através de uma série de competições individuais e em equipe para chegar ao topo. Deixando de lado suas objeções éticas ao projeto, Isagi se sente compelido a lutar para chegar ao topo, mesmo que isso signifique esmagar impiedosamente os sonhos de 299 jovens atacantes aspirantes.