No ano de 2020, a tecnologia está em toda parte. Cada dispositivo digital ao redor do mundo está conectado por uma rede singular onde os dados viajam. Sem o conhecimento dos humanos, essa rede se tornou o lar de formas de vida conhecidas como "Digimon". O estudante da quinta série Taichi Yagami está se preparando para o acampamento de verão quando estranhos acontecimentos começam em Tóquio; certos sistemas eletrônicos começam a enlouquecer. Ao descobrir que sua irmã e mãe estão presas em um trem incontrolável, ele corre para a estação próxima. De repente, Taichi é transportado para outro mundo onde ele encontra uma criatura estranha chamada Agumon, que de alguma forma já sabe seu nome. Taichi também recebe um estranho dispositivo chamado "Digivice", que lhe permite comunicar-se com o mundo não digitalizado. Taichi descobre que está na "Rede", e Digimon semelhantes a vírus estão atacando as áreas que mantêm os sistemas eletrônicos de Tóquio. Cabe a Taichi e seu novo parceiro Agumon parar esses ciberataques antes que o mundo inteiro seja ameaçado pelas ações de Digimon travessos.